Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:

- a -

• A : diffusion.Diffusion
• a : diffusion.Diffusion
• A_0 : diffusion.Diffusion
• A_0_to_res : diffusion.Diffusion
• A_1 : diffusion.Diffusion
• A_1_to_res : diffusion.Diffusion
• A_red : diffusion.Diffusion
• atoms_kinds : reeb_graph.Reeb_Graph
• atoms_kinds_aux : reeb_graph.Reeb_Graph
• aux : diffusion.Diffusion
• axes : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• axis : reeb_graph.Reeb_Graph

- b -

• B : diffusion.Diffusion
• b : diffusion.Diffusion
• B_red : diffusion.Diffusion
• backbone : reeb_graph.Reeb_Graph
• balls : diffusion.Diffusion
• balls_centres : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• balls_radii : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph

- c -

• c : diffusion.Diffusion
• chain : diffusion.Diffusion
• close_loops_with_boundary_conditions : diffusion.Diffusion
• CLUSTERS : diffusion.Diffusion
• covering : reeb_graph.Reeb_Graph
• cubic_to_res : diffusion.Diffusion
• cut_paths_until_A_0 : diffusion.Diffusion

- d -

• D : diffusion.Diffusion
• D_flow : reeb_graph.Reeb_Graph
• D_force_graph : diffusion.Diffusion
• d_Li : diffusion.Diffusion
• d_P : diffusion.Diffusion
• D_reeb_w : reeb_graph.Reeb_Graph
• d_S : diffusion.Diffusion
• d_x : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• d_y : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• d_z : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• DEADLOCKS : diffusion.Diffusion
• delta : reeb_graph.Reeb_Graph
• dim : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• direction : diffusion.Diffusion
• distances_to_balls : reeb_graph.Reeb_Graph
• distances_to_balls_aux : reeb_graph.Reeb_Graph
• DIV : reeb_graph.Reeb_Graph

- e -

• E : reeb_graph.Reeb_Graph
• e : diffusion.Diffusion
• edge_idxs : diffusion.Diffusion
• eps : diffusion.Diffusion

- f -

• fat_radius : reeb_graph.Reeb_Graph
• flow : reeb_graph.Reeb_Graph

- g -

• G : reeb_graph.Reeb_Graph
• geod : diffusion.Diffusion
• geod_A_0 : diffusion.Diffusion
• geod_A_1 : diffusion.Diffusion
• GF : diffusion.Diffusion
• grad_pen : diffusion.Diffusion
• graph : reeb_graph.Reeb_Graph
• grid : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• grid_size : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• grid_to_res_grid : diffusion.Diffusion

- i -

• idxs : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• idxs_A_0 : diffusion.Diffusion
• idxs_A_1 : diffusion.Diffusion
• idxs_to_edge : diffusion.Diffusion
• inputfile : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• ITRIS : diffusion.Diffusion

- k -

• K_graph : diffusion.Diffusion

- l -

• Li : diffusion.Diffusion
• linestyle : diffusion.Diffusion
• linewidth : diffusion.Diffusion

- m -

• M : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• m : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• M_x : diffusion.Diffusion
• m_x : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• M_y : diffusion.Diffusion
• m_y : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• M_z : diffusion.Diffusion
• m_z : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• max_flow : reeb_graph.Reeb_Graph
• measure_path_comp : reeb_graph.Reeb_Graph
• MIN : reeb_graph.Reeb_Graph
• MP : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph

- n -

• N : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• n : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• N_1 : diffusion.Diffusion
• N_2 : diffusion.Diffusion
• norm : reeb_graph.Reeb_Graph
• nx : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• ny : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• nz : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph

- p -

• P : diffusion.Diffusion
• PATHS : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• periodic : reeb_graph.Reeb_Graph
• pivot_cols : diffusion.Diffusion

- r -

• r_graph : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• r_graph_aux : diffusion.Diffusion
• r_Li : diffusion.Diffusion
• r_P : diffusion.Diffusion
• r_S : diffusion.Diffusion
• radii : reeb_graph.Reeb_Graph
• rank : diffusion.Diffusion
• rank_A : diffusion.Diffusion
• reeb_connected : reeb_graph.Reeb_Graph
• REEB_GRAPH : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• reeb_stride : reeb_graph.Reeb_Graph
• relax_z_axis : reeb_graph.Reeb_Graph
• repulsion : diffusion.Diffusion
• res_grid : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• res_to_A_0 : diffusion.Diffusion
• res_to_A_1 : diffusion.Diffusion

- s -

• S : diffusion.Diffusion
• save_RAM : reeb_graph.Reeb_Graph
• sign_var : diffusion.Diffusion
• simplify_grid_with_triangles : diffusion.Diffusion
• simply_connected_top_bottom : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• stride : reeb_graph.Reeb_Graph
• swap_res_grid_and_balls : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph

- t -

• t_step : reeb_graph.Reeb_Graph
• transform_points : reeb_graph.Reeb_Graph
• tri : diffusion.Diffusion

- u -

• unit_2d : reeb_graph.Reeb_Graph
• unit_3d : reeb_graph.Reeb_Graph

- v -

• V : diffusion.Diffusion
• v : diffusion.Diffusion
• V_ : diffusion.Diffusion
• verbose : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• VOL : reeb_graph.Reeb_Graph
• vtx : diffusion.Diffusion

- x -

• x : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph

- y -

• y : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph

- z -

• z : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• z_0 : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• z_1 : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph
• z_axis_boundaries : diffusion.Diffusion, reeb_graph.Reeb_Graph